شورای پژوهشی دانشکده پزشکی، مسئولیت هدایت و سیاست‌گذاری پژوهش‌های علمی در سطح دانشکده پزشکی را برعهده دارد. این شورا تلاش می‌کند تا فعالیت‌های پژوهشی با نیازهای نظام سلامت و اولویت‌های ملی و دانشگاهی هماهنگ باشد.

مهم‌ترین شرح وظایف این شورا عبارتند از:

۱. ابلاغ خط‌مشی‌های پژوهشی: ابلاغ اولویت‌های پژوهشی دانشگاه با توجه به نیازهای منطقه و کشور به گروه‌های آموزشی.

۲. بررسی و تصویب طرح‌های پژوهشی: بررسی طرح‌های پژوهشی ارائه‌شده توسط اعضای هیئت علمی و دانشجویان از نظر اعتبار علمی، اخلاقی و بودجه‌ای و تصویب آن‌ها برای اجرا.

۳. نظارت بر حسن اجرای طرح‌ها: پیگیری روند پیشرفت طرح‌های مصوب و دریافت گزارش‌های علمی و مالی از محققان در زمان‌های مقرر.

۴. هماهنگی با کمیته‌های اخلاق: بررسی ابعاد اخلاقی طرح‌ها (به‌ویژه طرح‌های بالینی و حیوانات آزمایشگاهی) و هماهنگی با کمیته اخلاق در پژوهش دانشگاه.

۵. ارزیابی و امتیازدهی: بررسی و ارزیابی خروجی‌های پژوهشی (مانند مقالات، پایان‌نامه‌ها و کتاب‌ها) برای محاسبه امتیازات علمی اعضای هیئت علمی و دانشجویان.

۶. تخصیص بودجه و اعتبارات: پیشنهاد نحوه توزیع اعتبارات پژوهشی و بودجه‌های عمرانی و تحقیقاتی دانشکده بین گروه‌ها و محققان.

۷. سیاست‌گذاری در مورد پایان‌نامه‌ها: تعیین ضوابط و معیارهای انتخاب موضوع پایان‌نامه‌ها جهت اطمینان از نوآوری و کاربردی بودن آن‌ها.

۸. بررسی مسائل پژوهشی: رسیدگی به مشکلات و موانع پژوهشی اعضای هیئت علمی و ارائه راهکار برای رفع آن‌ها.

این شورا تحت ریاست معاون پژوهشی دانشکده و با حضور اعضای شورا تشکیل جلسه می‌دهد.